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Bioinformatics for Clinical Diagnosis

About the Group

The general objective of this group is to improve the quality of life of the Mexican population through the exploration and design of computational tools that use large sources of clinical, radiological, epidemiological, genomic and molecular information to discover and / or identify experimentally valid biomarkers that allow make sound decisions in clinical practice and public health.

Research lines

- Analysis of data and computational and statistical methods for the identification of biomarkers.
- Computer-aided diagnosis and detection.
- Mathematical and computational models for the study of the epidemiology of diseases.
- Experimental validation of biomarkers in cellular, molecular, animal or patient models.

Leader

Víctor Manuel Treviño Alvarado - vtrevino@tec.mx

Core reserchers

José Gerardo Tamez Peña
Juan Emmanuel Martínez Ledesma

 

Adjunct researchers

Alejandro Santos Díaz
Jessica Giselle Herrera Gamboa
Manuel Alejandro Martínez Vázquez
Maricruz Sepúlveda Villegas
Rocío Patricia Rojo Gutiérrez

 

Publications

Top 5 of publications 2015-2019

- Acoustic sequences in non-human animals: A tutorial review and prospectus
Authors: Kershenbaum, A., Blumstein, D., Roch, M., Akçay, Ç., Backus, G., Bee, M., Bohn, K., Cao, Y., Carter, G., Cäsar, C., Coen, M., Deruiter, S., Doyle, L., Edelman, S., Ferrer-i-Cancho, R., Freeberg, T., Garland, E., Gustison, M., Harley, H., Huetz, C., Hughes, M., Hyland Bruno, J., Ilany, A., Jin, D., Johnson, M., Ju, C., Karnowski, J., Lohr, B., Manser, M., Mccowan, B., Mercado, E., Narins, P., Piel, A., Rice, M., Salmi, R., Sasahara, K., Sayigh, L., Shiu, Y., Taylor, C., Vallejo, E., Waller, S., & Zamora-Gutierrez, V.

- Understanding the HPV integration and its progression to cervical cancer
Authors: Oyervides-Muñoz, M., Pérez-Maya, A., Rodríguez-Gutiérrez, H., Gómez-Macias, G., Fajardo-Ramírez, O., Treviño, V., Barrera-Saldaña, H., & Garza-Rodríguez, M.

- A new gene expression signature for Triple-Negative breast cancer using frozen fresh tissue before neoadjuvant chemotherapy
Authors: Santuario-Facio, S., Cardona-Huerta, S., Perez-Paramo, Y., Trevino, V., Hernandez-Cabrera, F., Rojas-Martinez, A., Uscanga-Perales, G., Martinez-Rodriguez, J., Martinez-Jacobo, L., Padilla-Rivas, G., Muñoz-Maldonado, G., Gonzalez-Guerrero, J., Valero-Gomez, J., Vazquez-Guerrero, A., Martinez-Rodriguez, H., Barboza-Quintana, A., Barboza-Quintana, O., Garza-Guajardo, R., & Ortiz-Lopez, R.

- Comparison of gene expression patterns across 12 tumor types identifies a cancer supercluster characterized by TP53 mutations and cell cycle defects
Authors: Martínez, E., Yoshihara, K., Kim, H., Mills, G., Treviño, V., & Verhaak, R.

- Baseline knee adduction moment interacts with body mass index to predict loss of medial tibial cartilage volume over 2.5 years in knee Osteoarthritis
Authors: Brisson, N., Wiebenga, E., Stratford, P., Beattie, K., Totterman, S., Tamez-Peña, J., Callaghan, J., Adachi, J., & Maly, M.

Bioinformática para el Diagnóstico Clínico

Sobre el Grupo

El objetivo general del grupo de Bioinformática para el Diagnóstico Clínico es mejorar la calidad de vida de la población mexicana mediante la exploración y diseño de herramientas computacionales que utilizan grandes fuentes de información clínica, radiológica, epidemiológica, genómica y molecular para descubrir y/o identificar biomarcadores experimentalmente válidos que permitan tomar decisiones acertadas en la práctica clínica y en salud pública.


Líneas de investigación

- Análisis de datos y métodos computacionales y estadísticos para la identificación de biomarcadores.
- Diagnóstico y detección asistida por computadora.
- Modelos matemáticos y computacionales para  el estudio de la epidemiología de enfermedades. - Validación experimental de biomarcadores en modelos celulares, moleculares, animales, o pacientes.

Líder

Víctor Manuel Treviño Alvarado - vtrevino@tec.mx


Miembros

José Gerardo Tamez Peña
Juan Emmanuel Martínez Ledesma

 

Adscritos

Alejandro Santos Díaz
Jessica Giselle Herrera Gamboa
Manuel Alejandro Martínez Vázquez
Maricruz Sepúlveda Villegas
Rocío Patricia Rojo Gutiérrez

Publicaciones

Top 5 de publicaciones 2015-2019

- Acoustic sequences in non-human animals: A tutorial review and prospectus
Autores: Kershenbaum, A., Blumstein, D., Roch, M., Akçay, Ç., Backus, G., Bee, M., Bohn, K., Cao, Y., Carter, G., Cäsar, C., Coen, M., Deruiter, S., Doyle, L., Edelman, S., Ferrer-i-Cancho, R., Freeberg, T., Garland, E., Gustison, M., Harley, H., Huetz, C., Hughes, M., Hyland Bruno, J., Ilany, A., Jin, D., Johnson, M., Ju, C., Karnowski, J., Lohr, B., Manser, M., Mccowan, B., Mercado, E., Narins, P., Piel, A., Rice, M., Salmi, R., Sasahara, K., Sayigh, L., Shiu, Y., Taylor, C., Vallejo, E., Waller, S., & Zamora-Gutierrez, V.

- Understanding the HPV integration and its progression to cervical cancer
Autores: Oyervides-Muñoz, M., Pérez-Maya, A., Rodríguez-Gutiérrez, H., Gómez-Macias, G., Fajardo-Ramírez, O., Treviño, V., Barrera-Saldaña, H., & Garza-Rodríguez, M.

- A new gene expression signature for Triple-Negative breast cancer using frozen fresh tissue before neoadjuvant chemotherapy
Autores: Santuario-Facio, S., Cardona-Huerta, S., Perez-Paramo, Y., Trevino, V., Hernandez-Cabrera, F., Rojas-Martinez, A., Uscanga-Perales, G., Martinez-Rodriguez, J., Martinez-Jacobo, L., Padilla-Rivas, G., Muñoz-Maldonado, G., Gonzalez-Guerrero, J., Valero-Gomez, J., Vazquez-Guerrero, A., Martinez-Rodriguez, H., Barboza-Quintana, A., Barboza-Quintana, O., Garza-Guajardo, R., & Ortiz-Lopez, R.

- Comparison of gene expression patterns across 12 tumor types identifies a cancer supercluster characterized by TP53 mutations and cell cycle defects
Autores: Martínez, E., Yoshihara, K., Kim, H., Mills, G., Treviño, V., & Verhaak, R.

- Baseline knee adduction moment interacts with body mass index to predict loss of medial tibial cartilage volume over 2.5 years in knee Osteoarthritis
Autores: Brisson, N., Wiebenga, E., Stratford, P., Beattie, K., Totterman, S., Tamez-Peña, J., Callaghan, J., Adachi, J., & Maly, M.

Con su permiso

A Tec Sounds' show

A critical panel on the current and most pressing issues of the economy, society and politics of Mexico and the world. Our School of Social Sciences and Government experts delve into the different facets of a world full of contradictions and polarization, but in which there is also hope of a brighter future.

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Con su permiso

Un show de Tec Sounds

Un panel crítico sobre los temas actuales y más apremiantes de la economía, la sociedad y la política de México y del mundo. Los expertos de nuestra Escuela de Ciencias Sociales y Gobierno profundizan en las diferentes facetas de un mundo lleno de contradicciones y polarización, pero en el que cabe también la esperanza de un futuro más brillante.

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A Tec Sounds' show

Join Tec de Monterrey’s international journey of discovery and creation of the future of higher education. Host Pepe Escamilla and other experts from diverse disciplines will showcase innovative pedagogies, technologies and other educational developments at the service of enhanced learning outcomes.

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Un show de Tec Sounds

Acompaña al Tec de Monterrey en su viaje internacional de descubrimiento y creación del futuro de la educación superior. Nuestro anfitrión, Pepe Escamilla, y otros expertos de diversas disciplinas nos acercarán innovadoras pedagogías, tecnologías y otros desarrollos educativos al servicio de mejores resultados de aprendizaje.

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Historias para llevar

A Tec Sounds' show
Conecta

The audio version of Conecta, Tec de Monterrey’s news channel. We tell outstanding stories of students, professors, employees and alumni. Get to know the stories of a community that inspires, motivates and puts the name of Mexico in the spotlight.

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Ola de Salud

A Tec Sounds' show

Tec de Monterrey’s doctors, scientists and wellness experts talk about the things that make us live in a healthy, balanced and happy way. Following the pillars of TecSalud's vision of well-being, prevention and longevity, we share advice on these issues, combining science and experience in an entertaining and accessible way.

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Ola de Salud

Un show de Tec Sounds

Los médicos, científicos y expertos de bienestar del Tec de Monterrey hablan sobre las cosas que nos hacen vivir de manera sana, equilibrada y feliz. Siguiendo los pilares de la visión de TecSalud de bienestar, prevención y longevidad compartimos consejos sobre estos temas, combinando ciencia y experiencia de manera entretenida y accesible.

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