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Bioinformatics for Clinical Diagnosis

About the Group

The general objective of this group is to improve the quality of life of the Mexican population through the exploration and design of computational tools that use large sources of clinical, radiological, epidemiological, genomic and molecular information to discover and / or identify experimentally valid biomarkers that allow make sound decisions in clinical practice and public health.

Research lines

- Analysis of data and computational and statistical methods for the identification of biomarkers.
- Computer-aided diagnosis and detection.
- Mathematical and computational models for the study of the epidemiology of diseases.
- Experimental validation of biomarkers in cellular, molecular, animal or patient models.

Leader

Víctor Manuel Treviño Alvarado - vtrevino@tec.mx

Core reserchers

José Gerardo Tamez Peña
Juan Emmanuel Martínez Ledesma

 

Adjunct researchers

Alejandro Santos Díaz
Jessica Giselle Herrera Gamboa
Manuel Alejandro Martínez Vázquez
Maricruz Sepúlveda Villegas
Rocío Patricia Rojo Gutiérrez

 

Publications

Top 5 of publications 2015-2019

- Acoustic sequences in non-human animals: A tutorial review and prospectus
Authors: Kershenbaum, A., Blumstein, D., Roch, M., Akçay, Ç., Backus, G., Bee, M., Bohn, K., Cao, Y., Carter, G., Cäsar, C., Coen, M., Deruiter, S., Doyle, L., Edelman, S., Ferrer-i-Cancho, R., Freeberg, T., Garland, E., Gustison, M., Harley, H., Huetz, C., Hughes, M., Hyland Bruno, J., Ilany, A., Jin, D., Johnson, M., Ju, C., Karnowski, J., Lohr, B., Manser, M., Mccowan, B., Mercado, E., Narins, P., Piel, A., Rice, M., Salmi, R., Sasahara, K., Sayigh, L., Shiu, Y., Taylor, C., Vallejo, E., Waller, S., & Zamora-Gutierrez, V.

- Understanding the HPV integration and its progression to cervical cancer
Authors: Oyervides-Muñoz, M., Pérez-Maya, A., Rodríguez-Gutiérrez, H., Gómez-Macias, G., Fajardo-Ramírez, O., Treviño, V., Barrera-Saldaña, H., & Garza-Rodríguez, M.

- A new gene expression signature for Triple-Negative breast cancer using frozen fresh tissue before neoadjuvant chemotherapy
Authors: Santuario-Facio, S., Cardona-Huerta, S., Perez-Paramo, Y., Trevino, V., Hernandez-Cabrera, F., Rojas-Martinez, A., Uscanga-Perales, G., Martinez-Rodriguez, J., Martinez-Jacobo, L., Padilla-Rivas, G., Muñoz-Maldonado, G., Gonzalez-Guerrero, J., Valero-Gomez, J., Vazquez-Guerrero, A., Martinez-Rodriguez, H., Barboza-Quintana, A., Barboza-Quintana, O., Garza-Guajardo, R., & Ortiz-Lopez, R.

- Comparison of gene expression patterns across 12 tumor types identifies a cancer supercluster characterized by TP53 mutations and cell cycle defects
Authors: Martínez, E., Yoshihara, K., Kim, H., Mills, G., Treviño, V., & Verhaak, R.

- Baseline knee adduction moment interacts with body mass index to predict loss of medial tibial cartilage volume over 2.5 years in knee Osteoarthritis
Authors: Brisson, N., Wiebenga, E., Stratford, P., Beattie, K., Totterman, S., Tamez-Peña, J., Callaghan, J., Adachi, J., & Maly, M.

Bioinformática para el Diagnóstico Clínico

Sobre el Grupo

El objetivo general del grupo de Bioinformática para el Diagnóstico Clínico es mejorar la calidad de vida de la población mexicana mediante la exploración y diseño de herramientas computacionales que utilizan grandes fuentes de información clínica, radiológica, epidemiológica, genómica y molecular para descubrir y/o identificar biomarcadores experimentalmente válidos que permitan tomar decisiones acertadas en la práctica clínica y en salud pública.


Líneas de investigación

- Análisis de datos y métodos computacionales y estadísticos para la identificación de biomarcadores.
- Diagnóstico y detección asistida por computadora.
- Modelos matemáticos y computacionales para  el estudio de la epidemiología de enfermedades. - Validación experimental de biomarcadores en modelos celulares, moleculares, animales, o pacientes.

Líder

Víctor Manuel Treviño Alvarado - vtrevino@tec.mx


Miembros

José Gerardo Tamez Peña
Juan Emmanuel Martínez Ledesma

 

Adscritos

Alejandro Santos Díaz
Jessica Giselle Herrera Gamboa
Manuel Alejandro Martínez Vázquez
Maricruz Sepúlveda Villegas
Rocío Patricia Rojo Gutiérrez

Publicaciones

Top 5 de publicaciones 2015-2019

- Acoustic sequences in non-human animals: A tutorial review and prospectus
Autores: Kershenbaum, A., Blumstein, D., Roch, M., Akçay, Ç., Backus, G., Bee, M., Bohn, K., Cao, Y., Carter, G., Cäsar, C., Coen, M., Deruiter, S., Doyle, L., Edelman, S., Ferrer-i-Cancho, R., Freeberg, T., Garland, E., Gustison, M., Harley, H., Huetz, C., Hughes, M., Hyland Bruno, J., Ilany, A., Jin, D., Johnson, M., Ju, C., Karnowski, J., Lohr, B., Manser, M., Mccowan, B., Mercado, E., Narins, P., Piel, A., Rice, M., Salmi, R., Sasahara, K., Sayigh, L., Shiu, Y., Taylor, C., Vallejo, E., Waller, S., & Zamora-Gutierrez, V.

- Understanding the HPV integration and its progression to cervical cancer
Autores: Oyervides-Muñoz, M., Pérez-Maya, A., Rodríguez-Gutiérrez, H., Gómez-Macias, G., Fajardo-Ramírez, O., Treviño, V., Barrera-Saldaña, H., & Garza-Rodríguez, M.

- A new gene expression signature for Triple-Negative breast cancer using frozen fresh tissue before neoadjuvant chemotherapy
Autores: Santuario-Facio, S., Cardona-Huerta, S., Perez-Paramo, Y., Trevino, V., Hernandez-Cabrera, F., Rojas-Martinez, A., Uscanga-Perales, G., Martinez-Rodriguez, J., Martinez-Jacobo, L., Padilla-Rivas, G., Muñoz-Maldonado, G., Gonzalez-Guerrero, J., Valero-Gomez, J., Vazquez-Guerrero, A., Martinez-Rodriguez, H., Barboza-Quintana, A., Barboza-Quintana, O., Garza-Guajardo, R., & Ortiz-Lopez, R.

- Comparison of gene expression patterns across 12 tumor types identifies a cancer supercluster characterized by TP53 mutations and cell cycle defects
Autores: Martínez, E., Yoshihara, K., Kim, H., Mills, G., Treviño, V., & Verhaak, R.

- Baseline knee adduction moment interacts with body mass index to predict loss of medial tibial cartilage volume over 2.5 years in knee Osteoarthritis
Autores: Brisson, N., Wiebenga, E., Stratford, P., Beattie, K., Totterman, S., Tamez-Peña, J., Callaghan, J., Adachi, J., & Maly, M.

Acciones de impacto social ante COVID

Nuestro rol como actor social ante el COVID-19

El Tecnológico de Monterrey es una institución de la sociedad y para la sociedad. En estos momentos de crisis, ha destacado la fuerza y el compromiso de toda la comunidad del Tec. Con rapidez y efectividad de respuesta, y en colaboración con otras instituciones, hemos puesto las capacidades académicas, médicas y científicas de nuestra institución al servicio de la sociedad mexicana, reafirmando nuestro rol como actor social fundamental en nuestra comunidad. 

En este espacio publicamos las principales acciones de impacto que estamos realizando para la sociedad.

 

 

Acciones de impacto social ante COVID

Se han identificado +220 acciones emprendidas por diversos miembros de nuestra comunidad para enfrentar los desafíos que nos presenta la contingencia. Este espacio tiene como propósito compartir, conectar y potenciar estos proyectos, así como poner al servicio de la comunidad en general recursos de alto valor. 

acciones para informar y contener contagios

Acciones para informar y contener contagios
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Acciones para prevención y atención a la salud

Acciones para prevención y atención a la salud
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Acciones para la reactivación económica y social

Acciones para la reactivación económica y social
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acciones académicas

Acciones académicas
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Acciones de Desarrollo Integral

Acciones de desarrollo integral
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Cursos y webinars

Consulta la oferta de talleres y seminarios relacionados a los temas de impacto del COVID en materia de salud, economía y negocios, gobierno, emprendimiento y desarrollo integral.

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Transferencia de conocimiento acciones social covid tec

Transferencia de conocimiento

En esta sección encontrarás documentos y material de referencia para enfrentar la contingencia de COVID-19, los cuales están disponibles para su descarga, 

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Contacto Acciones con imapacto Social de Desarrollo Sostenible Tec de Motnerrey
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Acciones para informar y contener contagios

Coordinaciones con gobierno e iniciativa privada
Proyectos de investigación
Campañas de comunicación

Boost your skills

Boost Your Skills

On forming part of Tecnológico de Monterrey you will be able to develop new competencies and access specialized programs (MOOCs) offering credits from the best universities in the world.

Desarrolla Powerskills

Cursos y programas especializados para desarrollar Powerskills (habilidades blandas).

Profundiza

Cursos y programas especializados para profundizar más en tu carrera.

Complementa

Cursos y programas especializados para desarrollar habilidades que pueden complementar tu currículo y formación.

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Access specialized courses and programs
Access verified certified courses from over 60 universities through the initiative codes and enjoy innovative learning experiences of the highest quality to enhance your profile.
Coursera

Access +2,000 certificate courses to capitalize on the skills you already had through re-skilling or, in many cases, cross-skilling with new skills to consolidate your profile in current topics.

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Coursera for Campus
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How to access the courses?

To take one of the courses offered in Coursera for Campus, you will need to have an email with an @tec.mx, @tecsalud.mx or @itesm.mx domain and follow these instructions:

Steps:

1
2

Click on "Join for Free."

3

If you are a Tec student or collaborator, click on "Start Session with Tecnológico de Monterrey".

4

Sign in with your student ID or employee number.

5

Review the catalogue option to find out about the available courses.

Thematic areas of the courses:

You have until February 1, 2024 to enroll in the courses and until June 1, 2024 to finish them and receive your certificate.

 

edx Essentials

¿Cómo acceder a los cursos?

Ingresa a la página de edX. Registra tu usuario del Tec o si ya cuentas con uno haz login.

2

Llena el siguiente formulario e inscríbete con tu cuenta institucional.

3

En 48 horas recibirás el correo de acceso al menú de Edx, con más de 100 MOOCs de las mejores universidades y empresas del mundo.
 

Título
He leído y acepto los términos de AVISO DE PRIVACIDAD.

You have until June 29, 2024, to complete them.

Testimonials

“My name is Yeimy Gonzalez (17 years old). I live in Colombia and have been diagnosed with mixed cerebral palsy owing to prematurity, and study in the homeschooling modality. I am very grateful for everything I have learned. I really liked the teaching method because each topic is explained very clearly.”

Course: Introduction to Data Analysis for Decision Making

“I am a Computer Systems Engineer and currently work as a secondary school teacher, offering classes on informatics and science with an emphasis on physics. I studied this course to improve my teaching practice. I can’t stress enough how clearly the instructors explained the topics in video tutorials.”

Rubén Peña Martínez

Course: Physics, Dimension and Movement / Coursera

“I’m so grateful to the prestigious Tecnológico de Monterrey and Coursera for giving me the opportunity to participate. The course has helped me to acquire knowledge related to active learning and its special connection with the so-called emerging technologies.”

Course: Instructional Design for Active Learning

The instructors are excellent professionals. I’m very grateful for all their knowledge and way of communicating it. It has been a marvelous experience for my professional growth.”

Ana Milagros Mijares

Specialized course: Marketing with Social Networks / Coursera.

Boost your skills

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Por ser parte del Tecnológico de Monterrey podrás desarrollar nuevas competencias y tener acceso a cursos y programas especializados (MOOC's) de las mejores universidades del mundo que te dan valor curricular en tu formación.

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Accede a +2,000 cursos certificados que te permitirán hacer un re-skilling de habilidades que ya tenías o en muchos de los casos un cross-skilling con nuevas habilidades para robustecer tu perfil en temas de actualidad.

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Obtén certificación en cursos y programas especializados, a través de la alianza académica La Tríada.

¿Cómo acceder a los cursos?

Para poder tomar uno de los cursos que se ofrecen en Coursera for Campus necesitas tener un correo con dominio @tec.mx, @tecsalud.mx o @itesm.mx y seguir estas instrucciones:

Pasos a seguir:

1

Accede a través de tec.mx/latriada

2

Da clic al botón "Únete gratis" o "Join for Free."

3

Si eres alumno o colaborador del Tec, da clic en el botón "Inicia Sesión con Tecnológico de Monterrey".

4

Ingresa con tu matrícula o número de empleado.

5

Revisa la opción catálogo para conocer los cursos que están disponibles.

Áreas temáticas de los cursos:

Tienes hasta el 1º de Febrero de 2024 para inscribirte en los cursos y hasta el 1º de Junio de 2024 para terminarlos y recibir tu certificado.

edx Essentials

¿Cómo acceder a los cursos?

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Título
He leído y acepto los términos de AVISO DE PRIVACIDAD.

Tienes hasta el 29 de Junio de 2024 para terminarlos.

Testimoniales

“Mi nombre es Yeimy Gonzalez (17 años), vivo en Colombia, tengo un diagnostico de parálisis cerebral mixta por secuelas de prematurez, estudio modalidad Homeschooling. Estoy muy agradecida con lo que he aprendido, me gustó muchísimo su método de enseñanza porque explicaban muy claro cada tema.”

Curso: Fundamentos del Análisis de Datos para la toma de Decisiones.

“Soy Ing. en Sistemas Computacionales, actualmente trabajo como docente en secundaria dando la materia de informática y también la de Ciencias con énfasis en Física. Estudié este curso para mejorar mi práctica docente. Quiero resaltar la manera clara en que los instructores explicaron los temas a través de los vídeos tutoriales.”

Rubén Peña Martínez

Curso: Física, Dimensión y Movimiento / Coursera.

“Agradecido con el prestigioso Tecnológico de Monterrey y Coursera, por darme la oportunidad de participar. El curso me ha servido para obtener conocimientos relacionados con el aprendizaje activo, y su especial vinculación con las llamadas tecnologías emergentes.”

Curso: Diseño Instruccional para el Aprendizaje Activo.

Los profesores son excelentes profesionales, estoy muy agradecido por todo su conocimiento y forma de comunicarlo. Ha sido una experiencia maravillosa para mi crecimiento profesional.”

Ana Milagros Mijares

Programa Especializado: Marketing con Redes Sociales / Coursera.

prevencion y atencion a la salud covid tec

Acciones para prevención y atención a la salud

Coordinaciones con gobierno e iniciativa privada
Desarrollo de ventiladores
Hospitales
Diseño y donación de equipo médico y de protección
Diagnóstico
Proyectos de investigación
Recursos Educativos
alt

Acciones de Desarrollo Integral

Plataformas de colaboración
Talleres
Recursos educativos
Diseño de herramientas

Outliers – Privacy Notice

Identity and address of the responsible entity

"In the event of a discrepancy between the content of the English version and the original Spanish version the latter shall prevail".

The entity responsible for the personal information that you provide is Instituto Tecnológico y de Estudios Superiores de Monterrey (hereinafter “ITESM”), address Av. Eugenio Garza Sada Sur No. 2501, Colonia Tecnológico, Monterrey, Nuevo León, Mexico, C.P. 64700.

Personal data and sensitive personal data processed by ITESM

As part of your registration as a participant in the Outliers project, ITESM will collect and process the following categories of personal data: identification (including image and voice), contact, employment, academic and data related to your success story.

Primary purposes
  • ITESM will process your personal information for the following primary and necessary purposes:
  • To provide you with the necessary information on the project.
  • To carry out the selection process of your story. 
  • If your story is selected:
  • To manage the signing of the necessary document to publish your story.
  • To arrange with you the activities, meetings, events, and interviews required to produce the visual materials (image and video) to be published in the media deemed appropriate by ITESM.
  • To disseminate and/or disclose, through the media deemed appropriate by ITESM, the visual material that contains your success story.

We should like to inform you that you cannot ask ITESM to cease from processing your data for the aforementioned primary and necessary purposes, since such processing is necessary to comply with the obligations derived from the legal relationship established with you. 

Secondary purposes
  • ITESM will not use your personal information for any other purpose(s) that that or those indicated in the Primary Purposes section.
  • Transfers
  • ITESM will not transfer your personal data to any third party, except in the cases specified in article 37 of the Federal Law on Protection of Personal Data Held by Private Parties or if so required by a competent authority.
ARCO rights and/or revocation of consent

You or your legal representative can exercise any of your rights of access, rectification, cancellation or opposition (hereinafter “ARCO rights”), and revoke your consent for the processing of your personal data by sending an email and following the procedure, requirements, and deadlines for the exercise of your ARCO rights and/or revocation of consent on our webpage: https://tec.mx/es/derechos-arco-yo-revocacion-del-consentimiento

Please note that we cannot address your request or terminate use immediately in every case, since a legal obligation could be in place that requires us to continue to process your data. 

Use of Cookies

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Changes to this Privacy Notice

ITESM will notify you of any changes to this privacy notice on the webpage: https://tec.mx/es/outliers/aviso-de-privacidad 

Last Update: 20/05/2020

Outliers - Aviso de Privacidad

Identidad y domicilio del Responsable

El Responsable del tratamiento de los datos personales que usted proporcione, es el Instituto Tecnológico y de Estudios Superiores de Monterrey (en lo sucesivo "ITESM") con domicilio ubicado en Av. Eugenio Garza Sada Sur No. 2501, colonia Tecnológico en Monterrey, Nuevo León. C.P. 64700.
Datos personales y datos personales sensibles tratados por el ITESM
El ITESM como parte del registro como participante del proyecto Outliers, recabará y tratará datos personales de identificación (incluyendo su imagen y voz), contacto, laborales, académica y la asociada a su historia de éxito.

Asimismo, le informamos que, para cumplir con las finalidades primarias y necesarias señaladas en el presente Aviso, el ITESM no recabará ni tratará datos personales sensibles.

Datos personales y datos personales sensibles tratados por el ITESM

El ITESM como parte del registro como participante del proyecto Outliers, recabará y tratará datos personales de identificación (incluyendo su imagen y voz), contacto, laborales, académica y la asociada a su historia de éxito.
Asimismo, le informamos que, para cumplir con las finalidades primarias y necesarias señaladas en el presente Aviso, el ITESM no recabará ni tratará datos personales sensibles.
 

Finalidades primarias

ITESM podrá tratar sus datos personales para cumplir con alguna(s) de las siguientes finalidades primarias y necesarias:

  • Para brindarle la información necesaria en relación con el proyecto.
  • Para llevar a cabo el proceso de selección de su historia.
  • En caso de que su historia haya sido seleccionada:
  • Para gestionar la firma de los documentos necesarios para la publicación de su historia.
  • Para concertar con Usted las actividades, reuniones, eventos y entrevistas que se requieran para realizar la producción del material visual (imagen y video) a ser publicado en los medios de difusión que considere el Itesm.
  • Para difundir y/o divulgar, a través de los medios de difusión que considere el Itesm, el material visual que contenga su historia de éxito.

Le informamos que usted no puede oponerse para que ITESM cese el tratamiento de sus datos para las finalidades primarias y necesarias, anteriormente mencionadas, en virtud de que el tratamiento es necesario para cumplir con las obligaciones derivadas de la relación jurídica establecida con Usted.
 

Finalidades secundarias

El ITESM no utilizará su información personal para ninguna finalidad distinta a la(s) señalada(s) en el apartado de Finalidades primarias.

Transferencias

El ITESM no transferirá sus datos personales a ningún tercero, salvo en aquellos casos previstos por el artículo 37 de la Ley Federal de Protección de Datos Personales en Posesión de los Particulares o bien porque ha sido requerida por alguna autoridad competente.

Derechos ARCO y/o revocación del consentimiento

Usted o su representante legal podrá ejercer cualquiera de los derechos de acceso, rectificación, cancelación u oposición (en lo sucesivo “derechos arco”), así como revocar su consentimiento para el tratamiento de sus datos personales a través del correo electrónico y siguiendo el procedimiento, requisitos y plazos para el ejercicio de sus Derechos ARCO y/o revocación del consentimiento de nuestra página de internet: https://tec.mx/es/derechos-arco-yo-revocacion-del-consentimiento

Es importante que tenga en cuenta que no en todos los casos podremos atender su solicitud o concluir el uso de forma inmediata, ya que es posible que por alguna obligación legal requeríamos seguir tratando sus datos personales.

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