Core Lab: Genomics
¿Qué es el Core Lab de Genomics?
Es el Laboratorio donde se realiza Secuenciación Genómica Masiva de Última Generación (NGS, por sus siglas en ingles). Su visión es contribuir a fortalecer la investigación, la generación y la transferencia de conocimiento en México, a través de la generación y el análisis de datos genómicos aplicados de manera transversal en áreas como: medicina clínica, medicina genómica, agroindustria, alimentación, diagnóstico de enfermedades, estudio de muestras medioambientales, epidemiología genómica, entre otras.
Para conocer los servicios de análisis bioinformático, favor de referirse al correo tecbase@servicios.tec.mx.
¿Por qué colaborar con Core Lab Genomics?
Es el único laboratorio a Nivel Nacional que cuenta con todos los equipos de tecnología Illumina, desde el más pequeño (Iseq) hasta el más grande (Novaseq), lo que nos permite atender una gran diversidad de muestras para secuenciar, desde genomas pequeños de microorganismos hasta grandes cantidades de genomas de organismos complejos. Tenemos montados diversos servicios como: secuenciación de genoma completo (WGS), exoma, RNA-seq, secuenciación de célula única (single cell), metagenómica shotgun, metagenómica 16s, secuenciación de fragmentos específicos, DNA ambiental.
De igual forma, otro gran valor agregado es que el modelo de operación permite brindar servicio a investigadoras e investigadores externos al Tecnológico de Monterrey, además de que los acuerdos comerciales con Illumina nos permiten dar precios competitivos en América Latina y el tiempo de entrega de resultados es competitivo a nivel internacional. De igual forma, contamos con especialistas altamente capacitados, quienes, junto con el equipamiento periférico automatizado de generación de librerías, nos permite ejecutar proyectos de una forma robusta, eficiente y confiable. Finalmente, la experiencia del recurso humano del Core Lab Genomics nos permite atender de forma personalizada proyectos de diversas áreas: alimentos, medicina, industria agrícola y diagnóstico, entre otros.
Redes de colaboración activas de Core Lab Genomics:
• IMSS-Siglo XXI – México. Actualmente trabajamos en un proyecto relacionado a muestras clínicas de recurrencia de cáncer.
• Universidad de Azuay – Ecuador. Estamos trabajando con varios proyectos relacionados a uso de probióticos de alimentos fermentados.
• INMEGEN – México. Secuenciación del exoma humano.
• Instituto de Ciencias del Mar y Limnología UNAM – México. Genómica poblacional.
• Universidad del Mar - UMAR, Campus Puerto Ángel. DNA ambiental.
• Instituto Nacional de Cancerología - INCan. Metagenómica shotgun y exomas.
• Museo del Desierto - MUDE. Genómica de la conservación y transcriptimica para la caracterización de moléculas bioactivas.
• Proyecto oriGen - Secuenciación de genoma completo de las y los mexicanos.
• Solena - Asesoramiento y consultoría en metagenómica agrícola.
• Escuela Nacional de Estudios Superiores de Morelia - Genómica poblacional de mangle.
Nuestro equipamiento y tecnología
El iSeq 100, es un Sistema ideal para la Secuenciación de genomas pequeños (bacterias, virus, plásmidos etcétera). Es ideal para realizar estudios de metagenómica de 16s.
Este equipo está enfocado a realizar estudios de metagenómica más profundos, realizar Secuenciación de genes blanco, nos permite obtener arriba de A 15 Gb de información con 25millones de lecturas and longitudes de lectura de 2 × 300 bp.
Es el equipo más grande para la realización de secuenciación en longitudes cortas que existe en el mercado. Se utiliza cuando los proyectos requieren secuenciación masiva de muestras o para alcanzar mayor profundidad de secuenciación; por ende, secuencias más robustas.
Contacto
Dra. Rocío Alejandra Chávez Santoscoy
Profesora Investigadora y Líder de Core Lab Genómics
chavez.santoscoy@tec.mx
tecbase@servicios.tec.mx